Постоянными членами СБ стали премьер-министр Владимир Путин, секретарь СБ Николай Патрушев, руководитель администрации президента Сергей Нарышкин, директор ФСБ Александр Бортников, спикеры палат Федерального Собрания Сергей Миронов и Борис Грызлов, глава МИДа Сергей Лавров, министр внутренних дел Рашид Нургалиев, министр обороны Анатолий Сердюков и директор Службы внешней разведки (СВР) Михаил Фрадков.
Остальными членами СБ назначены начальник Генштаба Юрий Балуевский, директор Федеральной службы по контролю за оборотом наркотиков (ФСКН) Виктор Иванов, министр юстиции Александр Коновалов, вице-премьер - министр финансов Алексей Кудрин, президент Российской академии наук Юрий Осипов, глава Пограничной службы ФСБ Владимир Проничев, генпрокурор России Юрий Чайка, глава МЧС Сергей Шойгу, а также представители президента в федеральных округах.
Стоит отметить, что в состав Совета безопасности при президенте Путине не входили ни директор ФСКН (тогда ее возглавлял Виктор Черкесов), ни глава погранслужбы ФСБ.
В соответствии с законом "О безопасности" все решения СБ принимаются его постоянными членами на заседании совета большинством голосов, а "непостоянные" члены совета имеют лишь право совещательного голоса.